ども。

とりあえず私のとこも動いてません。
Selector版（autopagerize_selector.user.js）をお使いの場合、ざっと見て直してみたんですが、IE9でAutoPagerizeが正しく動かないパターンに入っちゃったみたいで動きませんでした。
http://wedata.net/items/27878

IE8でどうだかは試せていません。

Selector版じゃなくてXPath版を使ってる場合ですけど、fubで確か対応していない「not」が使われてるからですかね。

来月に1年ぶりに開発環境に戻るのですが、モチベーションがあれば直したいとは思っています。
1年も触ってないのでちょっと自信が無いのですが…